Un système de dépistage rapide contribue à la réduction du nombre de SE transmis par les œufs aux États-Unis

L'infection à Salmonella Enteritidis* (SE) transmise par les œufs a été considérablement réduite dans l'industrie commerciale des œufs aux États-Unis. Après l'apparition de cas dans l'Union européenne au début des années 1970, le foyer index est apparu en 1979 en Nouvelle-Angleterre. Il s'est ensuite étendu aux États du centre du littoral atlantique au début des années 1980 et a finalement émergé dans les régions du sud-ouest et du Pacifique dans les années 1990. Le nombre total de cas de SE aux États-Unis a culminé à 10 200 en 1995, mais a chuté à 5 000 en 2005. Les taux d'incidence dans les États du centre du littoral atlantique, la région la plus touchée, ont atteint 9,1 pour 100 000 en 1994. En 2007, le niveau était plus bas, avec 2,5 pour 100 000 habitants. Les centres américains de contrôle et de prévention des maladies ont estimé que les 5 333 cas confirmés de SE représentaient en réalité 170 000 cas au niveau national, dont 108 000 étaient attribués à la consommation d'œufs infectés. Indépendamment de la validité de ces projections, fondées sur une série d'hypothèses contestées, il était évident qu'un problème existait, ce qui a stimulé l'intervention du gouvernement fédéral.

Programmes d'assurance de la qualité des œufs

À la fin des années 1990, les différents États ont mis en place des programmes d'assurance de la qualité des œufs exigeant des producteurs qu'ils se conforment à des normes minimales en matière de biosécurité, de réfrigération après conditionnement, de vaccination, d'analyse des troupeaux en vue d'une contamination environnementale et de détournement des œufs provenant de troupeaux infectés vers le cassage et la pasteurisation. L'élimination de l'infection transmise verticalement à travers les générations successives, depuis les lignées pures jusqu'au stock parental, était essentielle pour parvenir à une réduction significative de la prévalence de l'ES dans les troupeaux. Le National Poultry Improvement Plan (NPIP), établi au début des années 1930, est responsable de la coordination des activités fédérales, étatiques et industrielles visant à éradiquer les infections à transmission verticale. Le plan impose des procédures opérationnelles, approuve des tests de diagnostic et certifie les couvoirs qui fournissent des poussins d'un jour et des dindonneaux. Initialement axé sur l'éradication de l'infection à Salmonella pullorum, le NPIP s'intéresse désormais aux souches de ponte SE, ainsi qu'à d'autres agents pathogènes présents dans un large éventail d'espèces aviaires. Le respect des exigences du plan national d'amélioration de la volaille garantit un approvisionnement en poulettes commerciales de remplacement provenant de couvoirs certifiés exempts de SE. Il s'agit là d'un fondement essentiel des efforts déployés par l'industrie pour prévenir le SE dans les troupeaux commerciaux. En 2003, une marque d'œufs distribuée au niveau national a introduit un programme rigoureux de prévention de l'ES impliquant la vaccination et une biosécurité renforcée exigée de tous les producteurs d'œufs franchisés. L'utilisation de kits de tests immunologiques à flux latéral a joué un rôle central dans la réussite de la mise en œuvre du programme. Étant donné que les troupeaux ont été contrôlés cinq fois entre le jour du placement et la fin du deuxième cycle de production, un test rapide avec des paramètres appropriés était nécessaire à la place de la procédure microbiologique conventionnelle du Manuel d'analyse bactériologique (BAM) de la Food and Drug Administration (FDA).

RapidChek® SELECT™ - un test très sensible

Le test immunologique à flux latéral RapidChek® SELECT™ de Romer Labs est devenu la procédure de dépistage standard pour déterminer la présence d'une Salmonella du groupe D1 dans les écouvillons de traînée de fumier ou dans les bassins d'œufs. La procédure est considérée par la FDA comme équivalente à la méthodologie BAM, plus laborieuse et plus coûteuse. Après l'évaluation initiale de la méthode RapidChek®, il a été déterminé que le test présentait une sensibilité de 100 %, ce qui est essentiel pour un test de dépistage qui ne doit pas produire de faux négatifs. Parallèlement à la procédure d'approbation, la spécificité du test a été évaluée à 93 % lors de l'analyse de 141 isolats de Salmonella du groupe D1 et de 210 sérotypes de Salmonella n'appartenant pas au groupe D1. Il s'agit d'un paramètre important, car un faux positif dans un troupeau de 125 000 poules âgées de 45 semaines entraînera des coûts substantiels et perturbera les opérations. En appliquant la méthode BAM, un laboratoire commercial a examiné 2 412 échantillons de frottis en 2010, ce qui a donné 1 477 colonies "suspectes" nécessitant un examen plus approfondi. De ce complément, seuls deux échantillons positifs au SE ont été confirmés. Les résultats combinés de deux laboratoires de l'État du Midwest appliquant le test RapidChek® en 2010 et 2011 ont donné 106 résultats positifs "présumés" sur environ 14 000 écouvillons examinés. Des analyses bactériologiques de confirmation ont permis d'identifier 16 isolats SE à partir des échantillons de routine soumis par les producteurs. Les données d'un laboratoire d'un État occidental portant sur 1 162 écouvillons ont comparé la capacité du test RapidChek® à détecter les salmonelles du groupe D1 par rapport au test microbiologique conventionnel BAM. Onze positifs "présumés" ont été identifiés à l'aide du test immunologique à flux latéral, contre trois positifs SE en appliquant la procédure BAM.

Considérations pratiques

La spécificité d'un test de dépistage est importante du point de vue des pertes financières potentielles. On a calculé que si un test environnemental faussement positif était obtenu dans un troupeau à la période d'âge obligatoire de 40 à 45 semaines, le fait de retenir les œufs sur le marché ou de les diriger vers le cassage et la pasteurisation pendant une période de quatre semaines au cours de laquelle des tests de confirmation sont effectués pourrait coûter jusqu'à 75 000 dollars pour un troupeau de 125 000 poules, en fonction du prix du marché des œufs en coquille et du stock de cassage en vigueur. En 2010, peu après l'introduction de la règle finale de la FDA sur la prévention des salmonelles, une épidémie de grande ampleur associée à un complexe de l'Iowa a entraîné un rappel massif de 500 millions d'œufs. Ce cas, aberrant, était dû à une mauvaise gestion flagrante et ne reflétait pas les pratiques actuelles du secteur. Dans ce foyer de 2010, la première série d'analyses dérivées des audits menés par la FDA en appliquant sa méthodologie BAM a révélé un taux d'infection de 2,5 % des troupeaux examinés. Depuis, ce taux est devenu négligeable. Depuis 2011, aucun cas de SE attribué aux œufs n'a été signalé. Cela est dû au respect diligent des principes de la règle finale de la FDA et repose en grande partie sur la fréquence et l'intensité de la surveillance de l'environnement. Cela n'aurait pas été possible sans l'application du test RapidChek® SELECT™ SE, qui est utilisé par des laboratoires commerciaux et d'État pour effectuer des tests de dépistage et de conformité pour l'industrie. Les preuves épidémiologiques démontrent que l'infection par SE dans l'industrie de la volaille est désormais associée à la viande de poulet de chair et que les isolats SE représentent un pourcentage de plus en plus élevé des sérotypes de Salmonella récupérés dans les lavages de carcasses. En conséquence, des programmes de suppression et d'élimination sont appliqués, le kit SE étant la technique de dépistage privilégiée pour les troupeaux parents et les troupeaux en croissance dans l'industrie du poulet de chair aux États-Unis.